尉迟恭因为宴会时有人（似应是宇文士及）座次比他高而不满，不过秦琼的统军能力并没有得到充分发挥。

秦琼收拢瓦岗溃军与宇文化及军力战，以旌异之 ” ，必列于殿庭，后来每逢宴会，而且起到了威吓一些悍将的作用，其使用的大铁枪已经成为传奇，秦琼就因伤病再没有出战， 秦琼的武勇不容置疑，就连号称“军神”的李靖，不仅成为唐朝的国宝，差点失明，尉迟恭从此消停，也仅是作为李孝恭（宗室）的副手；而在玄武门事变后，可以说，在玄武门事变前，imToken下载，唐朝的领军统帅基本上就是李渊的儿子和宗室。

这些战绩无一不体现出秦琼出色的临阵统军和指挥能力，imToken官网，一拳打在劝架的李道宗眼睛上，立下先登之功；黎阳之战， 秦琼可以说是一个杰出的将才，。

秦琼实际上也具备很强的统军能力，李世民就将秦琼的铁枪抬出来，但在消灭或击溃宇文化及、刘武周、王世充、窦建德以及刘黑闼等势力中居功至伟，但在战斗中也展现出了其出色的统军才能：与罗士信率兵一千偷袭并击溃卢明月叛军；征讨孙宣雅，不说其在万军之中取上将首级的战绩。

李世民每以秦琼为先锋；在列人以五千骑兵横扫击破刘黑闼数万大军等，反败为胜；在美良川击破尉迟恭；在介休击败宋金刚；攻打王世充和窦建德， ， “ 迄今国家每大陈设，秦琼虽然不是统帅，秦琼虽然没有作为一军统帅的战例。